La actual Junta Directiva está presidida por Aitor Elizegi, cuya candidatura ganó las elecciones celebradas el 27 de diciembre de 2018, sucediendo en el cargo al anterior presidente, Josu Urrutia. Además, el presidente del Athletic Josu Urrutia explotó al final del partido al señalar en tono irónico «¡ En 2012, el afamado entrenador argentino Marcelo Bielsa, consiguió llevar al Athletic a la segunda final europea de su historia, cosa que el club no lograba desde hacía 35 años, y a una final de Copa. El Athletic había ganado el primer asalto, pero todo se resolvería en el estadio del club inglés, Old Trafford. Para esta final, disputada en el Estadio Santiago Bernabéu, Clemente alineó a: Zubizarreta, Goikoetxea, De Andrés, De la Fuente, Urkiaga, Liceranzu, Dani, Patxi Salinas, Endika, Urtubi y Argote. En febrero de 2011, el por entonces presidente de Osasuna, Patxi Izco afirmó tras la renovación de Nacho Monreal: «Si viene un equipo, camisetas de futbol 2021 escucharemos la oferta. Si viene el Athletic, que pague la cláusula y punto».
Además, realizó un buen trabajo con la cantera, subiendo al primer equipo a jugadores que más tarde tendrían un peso importante en la plantilla. Además, conversaba mucho con los jugadores, ayudantes, médicos, fisioterapeutas… Con una mirada, ya sabías lo que quería hacer. Aitor Elizegi fue el vencedor con 9264 votos, mientras que su rival en las urnas, cosechó 9179. Asimismo, 781 socios votaron en blanco, y los 116 votos restantes fueron considerados nulos. En aquellas elecciones participaron Aitor Elizegi y Alberto Uribe-Echevarría. En 1962, el Athletic pagó un millón de pesetas al C. D. Basconia por hacerse con los servicios del guardameta José Ángel Iribar, apodado el Chopo por su larga estatura. Otros jugadores destacables de esa época en el Athletic, fueron; Eneko Arieta (tercer máximo goleador de la historia del club, sin contar goles en Campeonato Regional), Fidel Uriarte, Txetxu Rojo, Ángel María Villar o Javier Irureta. El que más partidos disputó con el club fue José Ángel Iribar, con 614 en 18 temporadas.
Este acuerdo fue cancelado después de dos temporadas por Osasuna, por lo que tuvo que devolver la mitad del dinero ingresado (600 000 euros). En junio de 1998, el club navarro se encontraba en una delicada situación económica, por lo que llegó a un acuerdo con el club rojiblanco que duraría cuatro temporadas. Por otro lado, es uno de los cuatro únicos clubes profesionales de España, junto a Real Madrid, Barcelona y Osasuna, que no es una sociedad anónima deportiva, de manera que la propiedad del club recae en sus socios. Se contabilizaron un total de 22 176 votos, lo que supuso el 65,49 % de participación de los socios con derecho a voto, alcanzando así la máxima participación de la historia del Athletic. El Athletic cuenta con una masa social de 44 560 socios y 454 peñas oficiales. En la Copa, el Athletic volvió a llegar a otra final tres años después, tras eliminar a CD Alcoyano, Celta de Vigo, Málaga y Espanyol. No así en Copa, donde el Athletic llegó a la final tras una disputadísima semifinal contra el Valencia.
Su primera etapa finalizó en 1925. Pocos años más tarde, en 1929, regresó para hacer historia con el Athletic. Diseñó el equipo que durante los años 30 conquistó 4 campeonatos de liga y otros 4 de copa, equipo que se convirtió en el más laureado de la historia del Athletic. Osasuna recibiría 200 millones de pesetas y, a cambio, el Athletic podría tener un derecho preferencial por un jugador cada temporada y adquirirlo con un descuento del 30 % en el precio de su cláusula de rescisión. En el verano de 2005 abandonaron el club Santi Ezquerro, camisetas futbol baratas que se fue al F. C. Barcelona tras finalizar su contrato, y Asier Del Horno, traspasado al Chelsea FC por 12 millones de euros. Al igual que Pentland, Urkizu removió los campos de Vizcaya en busca de jóvenes talentos para el nuevo Athletic. El Athletic cayó en el grupo 2 junto al Betis, subcampeón de Andalucía, y el Cartagena, segundo de Murcia. Con Barnes el Athletic ganó por segundo y tercer año consecutivo la Copa del Rey de 1915 y 1916 respectivamente.